תנועת ירושלים, בהנהגת גדולי התורה, מפעילה בית הוראה ומערכת משפט.
מערכת המשפט של תנועת ירושלים מקדמת את מעמדם של בתי הדין לממונות, המיישבים מחלוקות לפי דין תורה, ונותנת להם סמכות לזמן את בעלי הדין, ומימון ציבורי.
בית ההוראה של תנועת ירושלים נותן מענה הלכתי מרבנים מחוגים שונים.