ארגון צהר פועל במטרה לטפח את הזהות היהודית של מדינת ישראל, מתוך הידברות וחיפוש אחר מרכיבי זהות משותפים. ארגון רבני צהר מקדם הקמת הנהגה רבנית ציונית הפועלת מכוחה התורני והמוסרי, ופותחת שערים לעולמות השונים של הציבור הישראלי.
פעילות צהר מתמקדת בשלושה תחומים.
1. הנהגה רבנית. - רבני צהר מובילים בעמדות הלכתיות ומנהיגותיות בכמה דרכים. מועצת רבני צהר, רבני בית ההוראה של צהר, מכון המחקר של צהר וכנסים לציבור הרחב.
2. השפעה ציבורית - ארגון רבני צהר משמש כתובת לקריאת הכיוון התורנית בנושאים העולים על סדר היום הציבורי.
לצהר נציגות קבועה בכנסת בוועדות שונות אשר מציגה את המבט היהודי בהצעות חוק שונות. רבני צהר מציגים בכלי התקשורת השונים את עמדותיהם בנושאים הציבוריים.
3. שירותי צהר – ארגון צהר פועל להנגשת שרותי הדת לכלל החברה.