מכון ישראלי לארכיאולוגיה נוסד בשנת 2002 במטרה להפיץ את הארכיאולוגיה בקרב ציבור רחב ומגוון, להעלות את קרנה של הארכיאולוגיה בחברה הישראלית ולתמוך בשימור המורשת המפוארת של ארץ-ישראל ובהפצתה ברבים.
מכון ישראלי לארכיאולוגיה הינו עמותה רשומה ומלכ”ר היחיד בארץ המאגד בקרבו את בכירי אנשי המקצוע בתחום החפירות הארכיאולוגיות, בתחום התכנון, השימור, השחזור ופיתוח אתרי העתיקות ובחשיפת הארכיאולוגיה לציבור הרחב באמצעות סיורים, הרצאות וכנסים.
המכון הינו גוף מוביל בישראל ביזום וניהול של פרויקטים ארכיאולוגיים קהילתיים.